Rapid and repeated evolution of myosin copy number in threespine stickleback
本論文は、スリッパウオが淡水環境に適応する過程で、筋肉発達の遺伝子ファミリー（MYH3C）のコピー数が急速かつ反復的に増幅し、これが適応進化のホットスポットとなっていることを明らかにしたものである。
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evolutionary biology
261 件の論文
進化生物学は、生命がどのように時間とともに変化し、多様な姿を形成してきたかを解き明かす分野です。遺伝子の働きから種間の関係まで、過去の証拠と現在の観察を結びつけることで、私たちの存在のルーツに迫ります。
Gist.Science は、bioRxiv から投稿される進化生物学の新しいプレプリントをすべて収集し、専門用語を噛み砕いた解説と、技術的な詳細をまとめた要約の両方をご用意しています。これにより、専門家だけでなく広く一般の方々が、最先端の研究成果をスムーズに理解できます。
以下に、進化生物学の最新プレプリントの一覧をご紹介します。
Transcriptional signatures underlying divergent lifestyles of endophytic and pathogenic fungi in early colonisation of wheat roots
本論文は、RNA シーケンスデータと新規ゲノム情報を統合し、小麦根の早期感染段階において、病原性菌 Gaeumannomyces tritici が宿主防御を回避する「隠密」な発現プロファイルを示す一方、共生菌 G. hyphopodioides はストレス応答や効果子発現を通じて宿主防御を誘導し、両者の異なる生活様式を決定づける転写応答の基盤を解明したものである。
Estimating the evolutionary fitness of specific synonymous codon changes
この論文は、分岐データに依存せず多型データのみを用いた新手法により、ショウジョウバエの同義コドン変異に対する自然選択が弱く（|2Ns| < 2.07）存在すること、そしてその推定値がコドン使用頻度や mRNA 二次構造の安定化など複数の独立した証拠と整合することを実証している。
Alternative splicing of a TPR domain determines mitochondrial versus plastid function of the only CLU family protein in Marchantia polymorpha
この論文は、単一の CLU 遺伝子を持つコケ植物（マクシオプティス・ポリモルファ）において、エクソン 22 のスプライシングによる TPR ドメインの構造変化が、ミトコンドリアと葉緑体の機能特異性を決定し、ゲノム再編成や遺伝子欠失を補うメカニズムを示していることを明らかにしたものである。
Sexual selection purges mutation load, but not overall genetic diversity in populations, decreasing vulnerability to extinction
この研究は、トビイロシワハムシを用いた長期実験進化と全ゲノム再シーケンシングにより、性選択が有害な変異を効率的に除去して絶滅リスクを低下させる一方で、集団全体の遺伝的多様性や適応可能性を損なうことなく、生殖形質の適応的分化を促進することを初めてゲノムレベルで実証したものである。
Evolutionary dynamics under phenotypic uncertainty
古典的な集団遺伝学の枠組みを拡張し、表現型の不確実性を数学的に扱う「確率的表現型遺伝学（ProP Gen）理論」を提案することで、従来の法則の破綻や「表現型浮力」などの新たな現象を解明し、がんや細菌の耐性獲得などにおける進化動態の予測を可能にした。
A natural history of AMR in Klebsiella pneumoniae: Global diversity, predictors, and predictions of evolutionary pathways
この論文は、4 万 7 千のクレブシエラ・ニューモニアエゲノムデータとハイパーキューブ遷移経路サンプリングを用いて、国や政策要因による AMR 獲得経路の多様性を解明し、アフリカ亜サハラ地域のデータを用いてその進化的予測モデルの有効性を検証したものである。
Evolution as Active Geometry: The Geometric State Equation of the Tree of Life
この論文は、進化が情報生成と幾何学的制約の相互作用によって記述される「能動的幾何学」であり、生命の樹が遺伝暗号の情報容量によって決定される双曲幾何（曲率κ≈1.245、埋め込み次元 n≈2）という普遍的な幾何学的状態方程式に従うことを、理論的導出と多様な生物データによる実証的検証によって証明したものである。
Reduced body size of Varroa destructor associated with varroa-resistant honey bee colonies across Europe
ヨーロッパ全域にわたる調査により、ミツバチのワロア耐性コロニーに寄生するダニ（Varroa destructor）は、非耐性コロニーに寄生するものと比較して体サイズが約 6.8% 小型化していることが示され、この形態的変化が耐性ミツバチの新たな選抜マーカーとして利用できる可能性が示唆されました。
Hypothesis: A modern human range expansion ~300,000 years ago explains Neandertal origins
本論文は、約 30 万年前にレヴァロワ石器技術を用いた現代人の集団拡大が、ヨーロッパではシマ・デ・ロス・フエソス人のような古人類との大規模な交雑によってネアンデルタール人を、アフリカではより限定的な交雑によって現代人の深層構造を形成したとする仮説の妥当性を示し、両者の共通点とゲノム的な違いを統合的に説明するものである。